В.А. Иваныця, А.Е. Боброва, А.Н. Остапчук, Й.Б. Кристофферсен, Н.В. Коротаева, Г.В. Лисютин, Н.Н. Чабан, Н. Штенников

Одесский национальный университет имени И.И. Мечникова, Украина, Институт морской биологии, биотехнологии и аквакультуры, Греческий центр морских исследований, Греция, Институт микробиологии и вирусологии им. Д.К. Заболотного НАН Украины, Киев

БИОЛОГИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ БАКТЕРИЙ ПОЧВ БАТИАЛИ И ПОВЕРХНОСТНЫХ ВОД ЧЕРНОГО МОРЯ

Метагеномный анализ морской воды Одесского прибережья выявил наличие представителей 1006 оперативных таксономических единиц (OTЕ) 8 основных отделов домена Bacteria. Установлено соотношение функциональных кластеров групп генов, что отвечают за биологические процессы, молекулярно-биологические функции и синтез клеточных компонентов. ПЦР-анализ выявил присутствие в пробах морской почвы уникальных специфических последовательностей нуклеотидов для представителей анаммоксбактерий родов Candidatus Brocadia и Candidatus Kuenenia, Scalidua wagneri и Scalidua sorokinii. Впервые в образцах глубоководной почвы сероводородной батиали Черного моря обнаружены аэробные микроорганизмы, характерные для поверхностных вод, в количестве до 104 КОЕ. По результатам анализа жирно-кислотного состава и ПЦР-анализа исследуемые штаммы отнесены к 15 видам аэробных бактерий, образующих эндоспоры.

Ключевые слова: Черное море, батиаль, планктон, микробиота, биологическое разнообразие, 16S рРНК анализ, метагеномика

V.O. Ivanytsia, O.Y. Bobrova, A.M. Ostapchuk, J.B. Kristoffersen, N.V. Korotaeva, G.V. Lisyutinг, M.M. Chaban, M. Shtennikov

I.I.Mechnykov Odesa National University, Ukrainе, Institute of Marine of Biology, Biotechnoloy and Aquaculture, Hellenic Centre for Marine Research, Greece, D.K. Zabolotny Institute of Microbiology and Virology of NAS of Ukraine, Kyiv

BIOLOGICAL DIVERSITY OF BATHYAL ZONE SOIL AND SURFACE WATER OF THE BLACK SEA

The metagenome analysis of the seawater along Odesa coast revealed the presence of 1006 operational taxonomic units (OTU) belonging to 8 main phyla of Bacteria Domain. There was established the correlation of functional gene clusters responsible for biological processes, molecular-biological activity and cellular components synthesis. The PCR analysis of marine soil samples revealed the unique specific nucleotide sequences of anammox bacteria genera Candidatus Brocadia and Candidatus Kuenenia, Scalidua wagneri and Scalidua sorokinii. For the first time anaerobe microorganisms typical for surface water were explored in samples of the Black Sea deepwater bathyal zone soil in amount up to 104 CFU. The fatty acid composition and PCR analysis showed that studied strains belong to 15 species of aerobic endospore-forming bacteria.

Keywords: Black Sea, bathyal zone, plankton, microbiota, biological diversity, 16S rRNA analysis, metagenomics